平安時代、
公事や宮中行事を司る臨時の職として定められたのが初見であり、当初は責任者である
公卿以下の
官人を指したが、後には実務を担当する
蔵人・
弁官・
外記などを指すようになった。
鎌倉幕府成立以降は、
幕府、
守護、
国人領主の家政を司る職掌のひとつとして定められた。幕府や
守護大名が定める奉行職は中堅幹部や吏僚としての性質が強かったが、国人領主における奉行職の場合は主に領主を補佐し、家政を総覧する
宿老や
家老級の地位を指す場合が多い。
江戸時代は幕府はもとより、大名の領国支配においても、江戸時代中期以降、
藩と称されるような官僚制的な性質の強い統治機構を形成するようになり、奉行は幕府や大名家において上級幹部から下級幹部に至るまで、その職名に多く採用されることとなった。