これらの関所を通行しようとする者は、
通行手形を提示し、関所による確認を受けた。特に江戸から西方へつながる東海道沿いの関所では、女性と
鉄砲の通行が厳しい制限を受けていた。これを「
入鉄砲出女」と言うが、江戸在住の大名の妻が密かに領国へ帰国することと、江戸での軍事活動を可能にする江戸方面への鉄砲の流入の2つが、幕府によって厳重に規制されたのである(童謡「
通りゃんせ」)。また、
芸人や
力士などは通行手形の代わりに芸を披露することもあった。関所破りは重罪とされ、
磔刑に処せられた。しかし実際には関所役人も関与した宿場ぐるみでの関所破りが常態化していたという。